Marvels Midnight Suns повествует о судьбе Охотника – древнего полудемона, который был призван для борьбы с Лилит. Охотник станет аватаром игрока, и внешний вид героя можно настроить по своему усмотрению. Помимо Охотника под нашим управлением окажутся Мстители и Полуночные Солнца, – именно тематикой классических комиксов и вдохновлялись создатели игры. На миссию игрок может отправить до трёх персонажей, включая главного героя. Боевая система совмещает классический для Firaxis геймплей пошаговой тактики с набором супергеройских способностей, выполненных в виде карточной игры. Каждому персонажу доступна колода из восьми карт с особыми эффектами. Разработчики постарались воплотить самые знаковые приёмы любимых героев, и многие игровые способности перекочевали в игру прямиком с большого экрана. Карточная система помогает разнообразить игровой процесс, поскольку теперь на вашу тактику влияет не только расклад на поле боя, но и набор имеющихся умений. Впрочем, если доступные карты покажутся вам бесполезными, вы всегда можете сбросить их и набрать новые способности из запаса. Герои набирают карты из общей колоды, так что потеря персонажа в бою далеко не всегда снижает вашу боеспособность. В отличие от классических пошаговых тактик, геймплей Marvels Midnight Suns делает упор на высокую динамику сражений. Вам не придётся методично выкуривать противников из укрытий; вместо этого вы прорезаетесь сквозь ряды злодеев, чтобы как можно быстрее закончить схватку серией эффектных приёмов, – всё, как и подобает настоящим супергероям. Расправляясь с рядовыми противниками, персонажи накапливают очки героизма, расходуемые на особо сильные карты. Героические способности придутся как нельзя кстати в битве с боссами, которые станут главным испытанием ваших навыков. Каждая схватка с боссом проходит в особых условиях и требует грамотной тактики, поощряя игроков за находчивость.
